Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLK1P49759 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLK1P49759 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms