Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIP4K2AP48426 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms