Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD4P46934 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms