Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms