Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP3P42574 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP3P42574 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms