Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms