Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms