Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GJA4P35212 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GJA4P35212 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms