Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNGA1P29973 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms