Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB2P29033 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB2P29033 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB2P29033 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GJB2P29033 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJB2P29033 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJB2P29033 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms