Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms