Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FGFR3P22607 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FGFR3P22607 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FGFR3P22607 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms