Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRHP20396 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRHP20396 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRHP20396 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRHP20396 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRHP20396 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms