Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDCP19113 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HDCP19113 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HDCP19113 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HDCP19113 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HDCP19113 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDCP19113 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDCP19113 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDCP19113 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDCP19113 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDCP19113 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDCP19113 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDCP19113 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDCP19113 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDCP19113 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDCP19113 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms