Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms