Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CREB1P16220 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB1P16220 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms