Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB1P11230 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms