Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C8orf88P0DMB2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C8orf88P0DMB2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms