Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD2P0DJD1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms