Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERPIND1P05546 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms