Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZBED1O96006 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZBED1O96006 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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