Protein–RNA interactions for Protein: O75112

LDB3, LIM domain-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB3O75112 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LDB3O75112 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDB3O75112 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDB3O75112 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDB3O75112 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms