Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms