Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC28A2O43868 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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