Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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