Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMC8O43402 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms