Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBDO15205 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBDO15205 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBDO15205 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBDO15205 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBDO15205 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBDO15205 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBDO15205 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBDO15205 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBDO15205 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBDO15205 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBDO15205 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBDO15205 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBDO15205 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms