Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN25C9JDP6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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CLDN25C9JDP6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLDN25C9JDP6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLDN25C9JDP6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN25C9JDP6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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