Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DXG7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DXG7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DXG7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms