Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERINC4A6NH21 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms