Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CHTOPQ9Y3Y2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms