Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9Y3F1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms