Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIF3AQ9Y2N7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HIF3AQ9Y2N7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HIF3AQ9Y2N7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HIF3AQ9Y2N7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HIF3AQ9Y2N7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HIF3AQ9Y2N7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HIF3AQ9Y2N7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HIF3AQ9Y2N7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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