Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX6Q9UNH7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms