Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC2LQ9UL33 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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