Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MID2Q9UJV3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms