Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms