Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRIT1Q9P2V4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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