Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL9Q9P2J3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms