Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP36Q9P275 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms