Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms