Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCDHB16Q9NRJ7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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