Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms