Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4BQ9NPR2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms