Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C11orf49Q9H6J7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms