Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDGFDQ9GZP0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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