Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms