Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSD3Q9BZ95 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms