Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BCO2Q9BYV7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BCO2Q9BYV7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms