Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM55Q9BYV6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms